木材防腐处理有其优点，也有其缺点。如果防腐处理做的不好或不恰当，或防腐木材使用的场合不正确，则有些传统防腐剂及其防腐处理的木材会产生一些轻微危害。
木材强度
防腐处理或多或少都会对木材的力学性质产生一些影响，导致木材强度损失，但影响的大小，与一系列因素有关.包括木材质龋、尺寸、防腐前的预处理(尤其是木材含水率)、防腐处理工艺(压力高低、温度高低、时间长短等)、后处理、木材的二次干燥、防腐木材是甭再加工以及使用环境等。
但是，如果防腐剂、防腐处理工艺、木材加工等适当，则防腐处理导致的强度降低就很有限。一些木材防腐先进或发达国家，都对防腐处理工艺有具体要求，以防止或减少防腐剂(尤其是水载型防腐剂)处理导致的木材强度损失。
如果使用普通不防腐的木材，在湿环境中使用，腐朽虫蛀导致的木材强度损失会更大。例如，当腐朽导致木材质量损失达到5%～10%时，木材强度一般会降低20%～80%。木材腐朽的危害，还在于初期腐朽很难察觉和检测出来，当观察到腐朽时，木材强度的损失往往已经越过l0%。因此，从结构安全性的角度来说，使用防腐木材比使用普通(不防腐)木材的安全性更高。
